Расположение Национальный парк «Сайлюгемский» был создан в Республике Алтай на границе России и Монголии. Он стал первым нацпарком в регионе. Его территория состоит из трёх участков: «Сайлюгем», «Аргут» и "Уландрык".
Флора Местная флора своеобразна и неоднородна по составу. Так, на хребте Сайлюгем господствующим типом растительности являются степи и опустыненные степи. Большую площадь занимают высокогорные тундры. На заповедной территории произрастают растения, занесённые в Красную книгу Республики Алтай: астрагалы (аксайский, аргутский, коротколистный, морщинистый, Политова, роскошный, чуйский) и остролодочники (Ладыгина, Мартьянова, нижнеальпийский, пузырчатоплодный, пушистопузырчатый, Сапожникова).
Фауна Нацпарк «Сайлюгемский" - место обитания крупнейшей трансграничной группировки алтайского горного барана аргали (около 2600 особей) на границе России и Монголии. Здесь также расположены основные места его ягнения. Кроме того, в среднем и нижнем течении реки Аргут обитает крупнейшая группировка снежного барса, насчитывающая 20 особей (или четверть от всей популяции в стране). Национальный парк также является домом для одной из самых многочисленных в Алтае-Саянском экорегионе группировок сибирского горного козла (козерога). На хребте Сайлюгем обитает гнездовая группировка сокола-балобана, численность которого в регионе находится под угрозой из‑за интенсивного браконьерского отлова. Среди представителей животного мира нацпарка особенно выделяется сайлюгемская популяция бурого медведя, которая занесена в Красную книгу Республики Алтай. Особи данного вида очень светлые, желтовато-белые со светлыми когтями, за что их называют белокоготными. На участке «Сайлюгем» постоянно обитает манул - небольшая дикая кошка, которая не встречается на других особо охраняемых природных территориях в Республике Алтай. С 2016 года в нацпарке ведётся мониторинг и изучение манула: создана первая учётная площадка, в проекте участвуют учёные со всего мира. Всего в нацпарке зарегистрировано 50 видов млекопитающих. На двух участках нацпарка встречается до 149 видов птиц. 20 из них занесены в Красную книгу Российской Федерации и Республики Алтай: мохноногий курганник, орлан-белохвост, степной орёл, беркут, бородач, чёрный гриф, белоголовый сип, балобан, сапсан, степная пустельга, алтайский улар, жемчужный вьюрок и ряд других.